История Крымского федерального университета имени В.И. Вернадского восходит к Таврическому университету, первому высшему учебному заведению в Крыму, которое было основано в 1918 году по инициативе Соломона Крыма.
Первые лекции для студентов начались в мае 1918 года на физико-математическом и медицинском факультетах, которые тогда располагались в Ялте. К осени 1918 года все пять факультетов университета — историко-филологический, физико-математический, юридический, медицинский и агрономический — были переведены в Симферополь. Они разместились в помещениях бывшего военного госпиталя, женской епархиальной школы, семинарии и в нескольких частных домах.
Среди основателей Таврического университета были учёные из Киевского университета. Они избрали первый Совет во главе с ректором профессором Романом Гельвигом, выдающимся деятелем медицинской науки. После его смерти 13 октября 1920 года ректором университета был избран Владимир Вернадский, член Академии наук.
После образования Советского государства университет был преобразован. 1 февраля 1921 года он был переименован в Крымский университет имени М. В. Фрунзе. В 1920-х и начале 1930-х годов университет служил базой для создания трёх высших учебных заведений: педагогического института, медицинского института и сельскохозяйственного института.
Университет получил широкое признание благодаря многим всемирно известным исследователям и учёным, которые учились и работали в нём. Среди самых известных выпускников университета — академики Дмитрий Щербаков (1922) и Игорь Курчатов, член Украинской академии наук Кирилл Синельников (1923), члены-корреспонденты Академии наук СССР Глеб Франк (1925) и Кирилл Щёлкин (1932).
На протяжении многих лет в первом высшем учебном заведении полуострова работали многие выдающиеся учёные России. Среди них были Владимир Обручев, Александр Байков, Владимир Палладин, Абрам Иоффе, Игорь Тамм и другие.
4 августа 2014 года был издан указ о создании Крымского федерального университета имени В. И. Вернадского. Новый университет был создан путём объединения нескольких ведущих крымских научно-исследовательских и образовательных учреждений, что фактически означало воссоздание первоначальной структуры Таврического университета 1918 года. Потребовалось целое столетие, чтобы объединить основные высшие учебные заведения на полуострове.