Симферопольский государственный университет имени М.В. Фрунзе (Таврический национальный университет им. В.И. Вернадского) занимал важное место в международной научной кооперации. На его базе ежегодно проводилось до 70 конференций регионального, государственного и международного уровня, что позволило организовать тесное взаимодействие с учеными из различных государств. Вуз являлся членом Евразийской ассоциации университетов (2002 г.) и сети Причерноморских университетов (2008 г.). В декабре 2013 г. в университете состоялась международная школа по термодинамике, в рамках международного проекта «Аргос» и под патронатом кафедры ЮНЕСКО Таврического национального университета им. В.И. Вернадского.
В рамках реализации Болонской Декларации студенты факультета иностранной филологии Таврического национального университета им. В.И. Вернадского принимали активное участие в программах международного научного сотрудничества, выигрывали европейские гранты на обучение, научную и исследовательскую работу в зарубежных университетах Франции, Португалии, Германии, Греции, США и других стран. Осуществлена реализация многочисленных международных и национальных научных и образовательных программ и проектов (Германия, Франция, Греция, США, Испания).
За многие годы на базе Сельскохозяйственного института (Крымского государственного аграрного университета, Агротехнологического университета) организован учебно-научно-производственный комплекс, куда вошли 24 научных учреждения, учебных заведений аграрного профиля, в составе которого работают 79 докторов, профессоров и более 500 кандидатов, доцентов, привлекаемых к учебному процессу. Составной частью деятельности вуза является научно-исследовательская работа, которая направлена на фундаментальные, поисковые и прикладные исследования по перспективным направлениям сельскохозяйственной науки. Научная работа проводится в соответствии с тематикой важнейших направлений, определенных государственными научно-техническими программами: «Фундаментальные исследования», «Продовольствие», «Зерно», «Корма», «Белок» «Ветеринарное обеспечение», «Защита растений».
14 мая 2015 г. было принято решение о создании Физико-технического института Крымского федерального университета им. В.И. Вернадского на базе факультета физики и компьютерных технологий, кафедры медицинской физики и информатики Медакадемии КФУ, кафедры электроснабжения и физики Академии строительства и архитектуры, соответствующих специальностей других подразделений КФУ, а также Научного центра функциональных материалов и нанотехнологий. В новом институте наряду с уже существующими кафедрами и подразделениями созданы лаборатории коллективного пользования, научно — образовательные центры, лаборатории мезо — и нано- структурированных материалов, рентгеновских методов исследований, 3D моделирования и прототипирования, модернизированы лаборатории общего курса физики, телекоммуникационных технологий, микропроцессоров, информационной безопасности и др. Учеными института проводятся научные исследования широкого спектра оптических и нелинейных явлений, усовершенствования элементной базы квантовой электроники, волоконной и интегральной оптики, магнитных явлений.
